CRH6F-A智能版列车相较于CRH6F-A进行列一系列改进，首先，列车更智能，对标复兴号智能动车组，全车厢覆盖WIFI信号，实现全场景智能化运用，提高旅客的乘坐体检，提高故障处理效率，减少司机、机械师、乘务员的工作量。增加信息显示器，更具科技感，增加全车卫生间和座位使用情况等信息提示，在每个门区新增动态地图，便于乘客了解站点信息。吊顶电视由18.5寸升级29寸LCD宽屏，实现分屏显示信息。配备智能分析主机，对乘客密度分析，引导乘客向舒适车厢移动。搭载车载PHM主机，实现故障预警判和车辆健康状态评估，提高动车组可用性。

更舒适，内装升级，采用全新座椅，优化座垫倾角，加强背部包裹感及舒适性，增加软质头枕，提升私密性及降噪性能。模块化结构设计，便于更改或维修。优化司机室空间区域，以人机工程为导向，为驾驶员提供合理化、舒适性的驾舱环境。

更经济，降低全寿命周期成本，通过优化设计和PHM系统应用，延长运用修周期，且减少近50%运用修工作量；将高级修周期从120万公里/4年逐步延长至165万公里/7.5年，大幅降低全寿命周期检修成本。性能更强，采用四方所牵引系统，加减速性能更强，在部分站距较短的线路上可以实现和时速200 km/h使用相同运行时刻。列车长度由101.4m缩短至100.5m，能够满足重联运行时长度与8辆编组列车一致，可使用相同的屏蔽门。

2021年04月01日，珠三角城际轨道交通招标采购30列CRH6型四编组动车组，其中7组为CRH6F-A。

2021年10月13日，新一代城际市域动车组亮相粤港澳生态环境青年论坛。

2023年10月26日，CRH6F-A-0667正式投入运营。

主辅一体化模式的牵引系统辅助变流器集成在主变流器柜体中，辅助逆变模块由主变流器中间直流环节取电，主变流器中间电压大于1500 V，因此在辅助逆变器后端需要增加降压的辅助变压器，滤波后输出三相AC 380 V。主辅一体化模式牵引系统辅助变流设备的冷却、散热等都可以与主变流器共享，同时辅助变流器不需要设置单独的辅助绕组，也不需要单独设置四象限变流器，因此设备的体积、重量等大幅降低。主辅一体化模式下，列车电制动时辅助变流器可以直接从中间直流环节取电，维持辅助系统正常工作，当动车组进入过分相区间时，主辅分离模式的辅助变流器无法工作，但主辅一体化模式下，列车动能转换为电能，牵引逆变器维持中间直流环节电压稳定，辅助系统正常运行。

牵引变流器采用一体化设计方案，即牵引变流器系统将牵引变流器、水冷装置、辅助逆变器和DC 110 V充电机一体化集成在同一箱体内。牵引变流器主要由预充电回路、四象限整流器模块、牵引逆变器模块、辅助逆变器模块和充电机模块组成。四象限整流器模块与逆变器模块共用中间直流1800 V母线，2 个四象限整流器模块和 2 个牵引逆变器模块均可独立运行。辅助逆变器模块与牵引逆变器模块统型化设计，可等同替换。此外，牵引变流器还设有无火回送和充电机应急启动功能。25 kV交流电从受电弓引下后，经牵引变压器降压为AC 970 V进入牵引变流器。四象限整流器将变压器副边交流电整流为DC 1800 V，2个四象限整流器互相错开一定的相位角度，减小对电网的谐波污染。2个四象限整流器的直流输出环节并联，再经牵引逆变器逆变成电压和频率均可控制的三相交流电以驱动电机。再生制动工况时，牵引电机处于制动发电状态，通过四象限整流器向电网馈电。辅助逆变系统从中间直流环节取电，将其逆变为3AC 380 V/50 Hz，为列车中压负载供电，全列2个辅助系统采用并网控制，全列贯通 3AC 380 V母线。充电机模块将3AC 380 V整流为DC 110 V供低压负载和蓄电池组供电。

CRH6A-A/CRH6F-A型城际动车组牵引辅助变流器冷却系统由功率模块一次散热用水冷基板和外置二次冷却装置构成。冷却装置由散热器、风机、集流盒、系统管路、支撑框架、水泵、膨胀水箱(含液位传感器、液位仪、压力调节阀)、散热器进水和出水口传感器(压力传感器、温度传感器)等部件构成,冷却单元通过支撑框架安装于变流柜内。