第二代CR200J与上一代相比有诸多改进，车体断面改为鼔型，车厢宽度和坐席与CR300和CR400系列相同，由3105 mm加宽至3360 mm，坐席宽度也将大幅度加宽，车辆间距缩短到800mm，风挡改为对波橄榄型双层折棚风挡，提高车体气密性，拖车空调机组原有一车两台的改为一台，车厢高度仍保持4433 mm，虽然车体宽度增加，但整体重量控制相较于第一代更优。座位数及布局与CR200J第一代保持不变，但坐席宽度有所增加且乘客使用的充电插座由坐席下部改为与CR300/400系列相同的位置，即二等座插座位于座椅接缝处下方，一等座位于中央扶手。

拖车控制网络由Lonwork改为Ethernet以太网，网络控制系统提升互联、互通和互控功能，动力车、拖车、控制车故障报警信息互通，形成统一的列车监测信息网。通讯、重联连接器采用矩形连接器，同时所有连接器插接采用螺栓固定方式，DC600V使用2个矩形连接器，正负极分开。车门由电控气动改为电控电动塞拉门，取消低站台停靠功能，取消站台补偿器。

列车网络结构

CR200JS-G型“高原双源动力集中动车组”是复兴号动车组家族的一员，专为拉萨至林芝、拉萨至日喀则设计的一款能够满足高原气候条件运行的混合动力动力集中动车组。动力车基于技术相对成熟的HXD1D和FXN3，针对高原环境进行优化，同时，能够实现内电互控，车厢提供供氧设施，能够适应高原地区的线路环境，可以在最高5100 m海拔运行。电力动力车基于成熟的HXD1D，电机型号YQ-1224-4，总功率7200 kW，内燃动力车基于FXN3，配备两台12V265柴油机，采用中车大连电力牵引研发中心研制的8GCD-02100000 IGBT-VVVF，装机功率2×3500 kW，额定功率2×3250 kW，轴式2×(A1A-A1A)，轮周牵引功率2×2700 kW。

列车设计为灵活编组，但由于其特殊构造，不支持重联运行，动力车网络采用WTB+MVB以及ETH两套相互备份。列车最大支持编组15辆，其中拖车最大12辆；投入运行的列车编组12辆，动力车3辆，拖车9辆，其中二等座车6辆，二等座/餐车1辆，一等座车1辆，一等/商务座车1辆，定员755人，其中二等座629，一等座120，商务座6。由于增加了供氧设施，二等座车相较普通版本减少一排座椅，座位数由98变为93，除商务座外，其余坐席不支持旋转方向。

2021年03月12日，首组内燃动力车亮相。

2021年03月15日，首台电力动力车亮相。

2021年03月22日，首组拖车亮相并启程前往大连，与两组动力车共同进行实验。

首组车为特殊编组。HXD1D-J0001 + ZE290107 + ZE290106 + ZE290105 + ZY290108 + ZEC290104 + ZE290103 + ZE290102 + ZE290206 + ZE290205 + ZE290202 + ZE290201 + ZE290101 + FXN3-J0001B + FXN3-J0001A。首组车实验过程中动力车拆除了部分制动盘，电力动力车拆除两对，内燃动力车拆除三对，模拟更加恶劣的线路环境，测试车辆能否在严苛的环境中稳定运行。

2021年03月23日，第二组电力动力车抵达北京进行试验。

2021年04月04日，第二组内燃动力车抵达北京进行试验。

2021年04月27日，结束在大连试验的特殊编组首组车启程前往西安。

2021年04月29日，首组车抵达西安。

2021年05月04日至09日，首组车在陇海铁路宝天段进行试验。

2021年05月05日，首辆一等/商务车亮相。

2021年05月11日，首组车经青藏铁路驶入西藏。

2021年05月26日，第三组车完整编组在株洲进行测试。

2021年06月08日，第二组动力车与前两组车剩余的六节拖车与第三组完整编组先后启程前往拉萨。

2021年06月25日，投入运营，开通拉萨至林芝D8981/4次，林芝-日喀则D8982/3、D8992/3次，拉萨至日喀则D8991/4。

2021年10月11日起，拉萨-林芝D8981次改为C881次，林芝-日喀则D8982/8983次改为C882/883次，日喀则-拉萨D8994次改为C894次，拉萨-日喀则D8991次改为C891次，日喀则-林芝D8992/8993次改为C892/893次，林芝-拉萨D8984次改为C884次，拉萨-林芝高峰线D9901/9902次改为C921/922次，同时增开拉萨-日喀则高峰线C923/924次。